新京报快讯(记者 许雯)新型冠状病毒的传染源至今未明。北京大学工学院生物医学工程系教授朱怀球团队1月24日发表的研究文章提示,蝙蝠和水貂可能是新型冠状病毒的两个潜在宿主,其中水貂可能为中间宿主。
上述研究文章题为“深度学习算法预测新型冠状病毒的宿主和感染性”,发表于bioRxiv预印版平台,研究使用的是基于深度学习算法开发的VHP(病毒宿主预测)方法,用以预测新型冠状病毒潜在宿主。
研究提示,与感染其他脊椎动物的冠状病毒相比,蝙蝠SARS样冠状病毒与新型冠状病毒具有更相似的感染模式。此外,通过比较所有宿主在脊椎动物上的病毒传染模式,发现水貂病毒的传染性模式更接近新型冠状病毒。
这说明,蝙蝠和水貂可能是新型冠状病毒的两个潜在宿主。
记者注意到,1月23日,中国科学院武汉病毒研究所研究员石正丽团队在bioRxiv预印版平台上发表文章“一种新型冠状病毒的发现及其可能的蝙蝠起源”。该研究表明,新型冠状病毒的自然宿主最有可能是蝙蝠,它与云南菊头蝠中存在的RaTG13冠状病毒一致性高达96%。
病毒感染力方面,朱怀球团队研究表明,新型冠状病毒的6个基因组都极有可能感染人类。预测结果提示,新型冠状病毒具有与严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)、蝙蝠SARS样冠状病毒(Bat SARS-like CoV)和中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)类似的感染人类的强大潜力。
【对话】
课题组成员、浙江大学医学院第一医院、传染病诊治国家重点实验室副主任肖永红
“新型冠状病毒与SARS病毒相似度很高”
新京报:研究有哪些主要发现?
肖永红:新型冠状病毒肺炎暴发以来,病毒的传染源一直没有找到。我们利用深度学习算法,分析了现有数据,包括新型冠状病毒及其他冠状病毒的基因序列,以及GenBank(基因数据库)中所有可用的脊椎动物病毒数据等。
研究发现,新型冠状病毒与其他冠状病毒有相似的传染过程。蝙蝠身上有多种冠状病毒,这些冠状病毒可能先传染至哺乳动物,再传染到人。比如MERS病毒,中间宿主就是骆驼。
对于新型冠状病毒来说,研究预测,蝙蝠是它的最主要来源,中间宿主可能是水貂。
新京报:研究主要基于日前公布的新型冠状病毒全基因序列吗?
肖永红:是的。对科学研究来说,病毒全基因序列非常重要。新型冠状病毒和相似病毒的进化分析,新型冠状病毒的检测方法,都基于全基因序列。另外,病毒发病机制研究、新型冠状病毒治疗药物及疫苗的研发,也基于全基因序列。
新京报:从全基因序列看,新型冠状病毒与SARS病毒有什么关联?
肖永红:我认为它和SARS病毒的类似度很高。首先,新型冠状病毒与SARS病毒同属于冠状病毒的β属,而且两种病毒的基因组序列80%相同,同源性很高。其次,从现有研究看,两种病毒入侵人体细胞的主要受体都是ACE2。第三,新型冠状病毒感染的肺炎发病时间也和SARS相似。
两者不是完全相同的病毒,但关联性很高。
新京报:昨天中国疾控中心首次公布成功分离的我国第一株病毒毒种信息及其电镜照片,这意味着什么?
肖永红:全基因序列是拿到了病毒的信息,中国疾控中心在实验室中把病毒培养出来了,这对于研究病毒致病机制、药物研发都非常有帮助,奠定了非常好的基础。通俗地说,全基因组序列找到了“贼”的证据,现在是把“贼”抓住了。
新京报记者 许雯
新型冠状病毒疫苗有望3个月后开展人体临床试验
美国卫生官员和科研人员23日在《美国医学会杂志》上发表观点文章称,自严重急性呼吸综合征(SARS)出现以来,医学界对冠状病毒的研究及技术进步可大幅缩短新型冠状病毒疫苗开发的时间,新型冠状病毒的候选疫苗有望在3个月后展开人体临床试验。
美国国家过敏症和传染病研究所所长安东尼·福奇和宾夕法尼亚州立大学医学院传染病专家凯瑟琳·保莱斯等人撰文说,从获得SARS冠状病毒的基因组序列到第一款疫苗的I期临床试验用了20个月,但此后对SARS冠状病毒和中东呼吸综合征(MERS)冠状病毒的研究为解码和应对新的冠状病毒提供了重要依据。
文章指出,SARS冠状病毒表面的刺突糖蛋白将人血管紧张素转化酶2作为入侵的主要受体。初步分析显示,新型冠状病毒与SARS冠状病毒具有一定程度的氨基酸同源性,可能也将人血管紧张素转化酶2作为受体。
美国贝勒医学院目前正与得克萨斯大学、纽约血液中心以及中国复旦大学合作开发疫苗。美国国家卫生研究院也在研究针对新型冠状病毒的疫苗。目前病毒疫苗开发平均耗时约3.25个月,在信使核糖核酸(mRNA)疫苗技术的帮助下,新型冠状病毒疫苗研发有望更迅速。
专家们还认为,广谱抗病毒药Remdesivir、抗逆转录病毒药物洛匹那韦/利托那韦、贝塔干扰素在动物实验中对中东呼吸综合征显示了一定疗效,目前研究人员正在评估它们是否可用于治疗新型冠状病毒。
文 / 健康时报全媒体平台记者 李桂兰
北京大学工学院生物医学工程系教授朱怀球团队1月24日发表的研究文章提示,蝙蝠和水貂可能是新型冠状病毒的两个潜在宿主,其中水貂可能为中间宿主。该研究“深度学习算法预测新型冠状病毒的宿主和感染性”发表于bioRxiv预印版平台。
据了解,该研究使用的是基于深度学习算法开发的VHP(病毒宿主预测)方法,用以预测新型冠状病毒潜在宿主。
研究提示,与感染其他脊椎动物的冠状病毒相比,蝙蝠SARS样冠状病毒与新型冠状病毒具有更相似的感染模式。此外,通过比较所有宿主在脊椎动物上的病毒传染模式,发现水貂病毒的传染性模式更接近新型冠状病毒。
课题组成员之一,浙江大学医学院第一医院、传染病诊治国家重点实验室副主任肖永红解释说,研究发现,新型冠状病毒与其他冠状病毒有相似的传染过程。蝙蝠身上有多种冠状病毒,这些冠状病毒可能先传染至哺乳动物,再传染到人。比如MERS病毒,中间宿主就是骆驼。对于新型冠状病毒来说,研究预测,蝙蝠是它的最主要来源,中间宿主可能是水貂。
而关于新型冠状病毒的感染力,朱怀球团队研究表明,新型冠状病毒的6个基因组都极有可能感染人类。预测结果提示,新型冠状病毒具有与严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)、蝙蝠SARS样冠状病毒(Bat SARS-like CoV)和中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)类似的感染人类的强大潜力。
昨天,中国疾控中心首次公布成功分离的我国第一株病毒毒种信息及其电镜照片,肖永红解释说,这对于研究病毒致病机制、药物研发都非常有帮助,奠定了非常好的基础。通俗地说,全基因组序列找到了“贼”的证据,现在是把“贼”抓住了。